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Discovery Studio2021是一款非常强大的化学实验软件,其主要功能是帮助用户在编辑化学教程时拥有更多的模型和图纸设计方案。当你需要分析化学或分析分子模型时,你可以通过Discovery Studio 将实验放在软件上,将其转换为三维分子模型,使您的实验结果在软件上运行更加清晰。
安装步骤
1、在本站下载解压文件。
2、单击exe文件。
3、选择安装路径。
4、点击安装。
5、在安装过程中,请稍候。
6、安装完成。
7、将破解补丁复制到安装路径。
8、破解完成。
软件功能
1.基本界面和显示模块
1、Discovery Studio Standalone
可视化界面是软件分子设计和模拟的基础,支持服务器-客户端安装在同一台机器上的运行模式。Pipeline Pilot 结合Server,提供化学/生物数据显示、模拟/分析、构建三维分子、显示动态变化、三维绘图等诸多功能。
2、Visualizer Client
它是用于访问和使用服务器端软件的服务器-客户端运行模式中客户端的可视化界面。Pipeline必须与服务器端配置 Pilot Server合作为用户提供无与伦比的数据、工作流程和计算资源共享。
二、蛋白质模拟模块
1、DS MODELER
只要将未知结构序列与另一个已知的三维结构蛋白进行比较,利用工业标准的快速同源模型建设方法,就可以自动快速生成优化的蛋白质同源模型。MODELER是目标发现和蛋白质家族功能结构分析的理想解决方案。还可以通过MODELER模拟蛋白质突变,模拟loop区域,比较基于结构的蛋白质结构模型,构建具有配体组合的蛋白质结构模型。结合Sequencee结合 Analysis模块可自动完成抗体Lop区模建。MODELER还可以结合软件中模拟和基于结构的药物设计的功能模块,对蛋白质结构和功能之间的关系进行深入研究。
2、DS Protein Refine
利用CHARMM优化模型构建的蛋白质侧链和loop区域,提高蛋白质模型的准确性。
3、DS Protein Health
合理的蛋白质三维结构评价工具。Protein 使用Profilesshealth模块 3D方法将三维结构的结构环境与特定氨基酸残基的优先外部环境进行比较,获得相关结构性质与氨基酸序列信息的关系。通过Protein 通过对Health模块的分析,用户可以轻松快速地在蛋白质结构中找到不合理的区域。
4、DS Protein Families
蛋白质功能机制可以通过分析蛋白家族蛋白序列的保守模式和三维结构中保守残基的位置来更好地理解。Protein Families简单易用的流程(protocols),从蛋白家族的序列或结构比较到进化痕迹分析,也可以逐步引导用户进行分析。进化跟踪分析包括用分层聚类的方法建立蛋白质家族系统树图,并在您的三维结构中绘制这些功能注释信息。在进行序列比较时,允许根据需要对比结果增加约束,提高活性部位关键残基的比较效果。
5、DS Sequence Analysis
比较功能已知的其他蛋白质的序列是确定蛋白质生物功能的第一步。使用Sequence Analysis还允许用户通过通用BLAST和PSI-BLAST算法搜索本地数据库或NCBI在线数据库,以确定蛋白序列的同源区域。结果显示在交互报告格式中,便于进一步分析和在其他模块中使用。当使用Blast搜索PDB或PDB_nr95数据库时,输出蛋白质的SCOP可以在文件中显示 ID, Ligand 信息,如ID和X射线分辨率。